Pusat Pengembangan Pendidikan (Pusbangdik) Poltekkes Kemenkes Jayapura lahir dengan Permenkes Peraturan Menteri Kesehatan Nomor 38 Tahun 2018 tentang Organisasi dan Tata Kerja Politeknik Kesehatan di Lingkungan Badan Pengembangan dan Pemberdayaan Sumber Daya Manusia Kesehatan Kementerian Kesehatan. 

Pusat pengembangan pendidikan pada era sebelum Permenkes No. 38 Tahun 2018 berbentuk unit. diawal lahirnya pusbangdik Poltekkes Kemenkes Jayapura di pimpin oleh Dr. Helda Nouvy Warou, S.Kep, Ns, MPH yang kemudian digantikan oleh Korinus Suweni, S.Kep, Ns, M.Sc dan pada saat ini yakni 2023-2024 dipimpin oleh Ardhanari H.Kusuma, S.Kep, Ns, M.Med.Ed. 

Beberapa inovasi telah dilakukan oleh Pusbangdik baik pada konteks kurikulum sebelum dan paska OBE. Disamping itu saat ini Pusbangdik telah merancang pembentukan lembaga penyelenggaran kegiatan yang nantinya terintegrasi dengan LMS Kemenkes dan menjadi salah satu unit bisnis Poltekkes Kemenkes Jayapura paska ditetapkan menjadi Badan Layanan Umum.